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【实验方法】明胶酶谱法检测 MMP 活性
人阅读 发布时间:2020-07-31 15:22
细胞外基质( extracellular matrix , ECM )是由大分子构成的错综复杂的网络。为细胞的生存及活动提供适宜的场所,并通过信号转导系统影响细胞的形状、代谢、功能、迁移、增殖和分化。
基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinase,MMP)可以降解细胞外基质成份,需要Ca2+、Zn2+等金属离子作为辅助因子,是一组具有许多共同生化性质的可降解细胞外基质的酶。基质金属蛋白酶2(MMP2)主要降解IV型胶原,基质金属蛋白酶9(MMP9)可以降解弹性蛋白、胶原蛋白、明胶和纤维蛋白等细胞外基质的成分。基质金属蛋白酶的失调是多种疾病发生、发展的重要机制之一。
明胶酶谱实验可以检测MMP2和MMP9的活性,是分子生物学的常用实验技术之一。先将样品进行SDS-PAM(SDS-PAGE,含0.1%明胶)电泳分离,然后在有二价金属离子存在的缓冲系统中使样品中的MMP-2和MMP-9恢复活性,在各自的迁移位置水解凝胶里的明胶,最后用考马斯亮蓝将凝胶染色,再脱色,在蓝色背景下可出现白色条带,条带的强弱与MMP-2和MMP-9活性成正比。
实验流程如下:
1.样品制备
组织或细胞的蛋白样品制备可用常规的方法,但需注意蛋白裂解液中不能加入EDTA,因为EDTA是金属离子螯合剂,可以络合Zn2+,抑制MMP的活性;也不能加入β-巯基乙醇或DTT,因为会导致蛋白的二硫键被打开,蛋白不能复性。推荐用PBS或Tris缓冲液(pH7.5)作为蛋白提取的缓冲液,可以加入0.5%的PMSF。
2.SDS-PAGE
1)SDS-PAGE 凝胶配制
10%分离胶 | 5%浓缩胶 | |
总体积 | 10mL | 6mL |
30%AM | 2.0mL | 0.75mL |
1.5M Tris-cl (PH 8.8) | 2.5mL | / |
1.0M Tris-cl (PH 6.8) | / | 0.76mL |
10%SDS | 0.1mL | 0.06mL |
10%AP | 0.1mL | 0.06mL |
TEMED | 8μl | 0.006μl |
明胶(10mg/mL) | 1.0mL | / |
超纯水 | 4.5mL | 4.5mL |
明胶母液配制后可在4℃保存,最好不超过1周。
2)电泳
4℃、常规电泳即可,可以适当延长电泳时间,至溴酚蓝完全出胶。上样量一般为50μg,可根据实验的具体情况和预实验结果调整。
注意:
①上样缓冲液中不能加入β-巯基乙醇或DTT,原因同上。
②样品与上样缓冲液混合后直接上样,样品不要煮沸,高温会导致蛋白不可逆的失活。
3.反应和显色
1)将凝胶置于洗脱液(2.5% Triton X-100,50mM Tris-HCl,5mM CaCl2,1μM ZnCl2,pH7. 6)中振荡洗脱2次,每次40分钟。
2)漂洗液(50mM Tris-HC,5mM CaCl2,1μM ZnCl2)漂洗2次,每次20分钟。
3)凝胶置于孵育液(50mM Tris,pH7.5,150mM NaCl,10mM CaCl2,1μM ZnCl2,0.02% Brij-35)中37℃ 孵育42-48小时。
4)染色液(考马斯亮蓝染色液)染色3小时。
染色液配方表
甲醇 |
乙酸 |
5%浓缩胶 |
30% |
10% |
0.5% |
5)脱色液A、B、C分别脱色(脱色液配方及时间见附表)。
脱色液配方及脱色时间
甲醇 | 乙酸 | 脱色时间 | |
A | 30% | 10 % | 0.5小时 |
B | 20% | 10 % | 1小时 |
C | 10 % | 5% | 2小时 |
脱色时间可以根据观察到的脱色效果调整。