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计算IC50常用的2种方法

52290 人阅读发布时间:2020-05-21 11:38

IC50(half maximal inhibitory concentration),即半抑制浓度,指某一种物质对某些生物程序抑制达到50%抑制效果时的浓度。对细胞增殖方面,可以理解为对细胞增殖的抑制效果达到细胞正常增殖水平50%时的药物浓度。通常用IC50来衡量药物对细胞的毒性或者细胞对药物的耐受能力,在药物实验中,常用IC50来评估实验中使用的药物浓度。IC50的计算方法很多,常用的有Excel、graphpad prism、SPSS等。

一、使用Excel计算IC50

首先将数据输入Excel中

 

抑制率 浓度 Lg(浓度)
21% 5 0.69897
32% 10 1
47% 20 1.30103
56% 30 1.47712125
67% 50 1.69897

因为药物浓度与抑制率的线性关系并不理想,因此需要用药物浓度的对数与抑制率作图。

药物浓度的对数与抑制率

药物浓度与抑制率作图,线性关系不好;

 

药物浓度的对数与抑制率

药物浓度的对数与抑制率作图,线性关系理想

根据线性公式计算抑制率为50%时的Y值,计算10为底,计算值为指数的冥,结果即为IC50。

二、使用graphpad prism计算IC50

打开软件后选择XY选项,Y值选择第一项: enter and plot a single y value for each poin,

点击create。 

使用graphpad prism计算IC50

在X和Y栏中分别输入药物浓度和抑制率:

药物浓度和抑制率

点击Analyze,在选项中选择:Transform concentration(X)

使用graphpad prism计算IC50

点击OK,在弹出的界面中选择Transform to logarithms。

使用graphpad prism计算IC50

再进入Analyze界面,点击OK,在弹出的界面中选择:Dose-response-Inhibition选项下的Log(inhibitor)vs.response—Variable slope(four parameters)。
使用graphpad prism计算IC50

结果如下,这一组数据的IC50为23.02
使用graphpad prism计算IC50

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MDL(Medical Discovery Leader)聚焦于医学科学基础研究与转化医学的研究,服务于国内以及国外科研人员,为疾病的诊断、预防、治疗提供研究基础。自有实验室超过6000平米,主营业务范围涵盖模型动物、细胞生物学、分子生物学、蛋白、病理学。经过10余年的发展,我们与国内超过百余家的研究机构上千名研究人员共同完成了12000+的实验项目。

 

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