服务内容1：蛋白三维结构建模-同源建模或从头建模
目前的获得蛋白结构的方式主要有三种：X-ray，NMR和电镜。如果实验室没有此条件，计算机模拟手段可以解决未知蛋白的三维空间结构，为您的课题提供助力；也可以通过同源建模或者从头建模方式计算获得空间三维结构，便于后期药学、分子生物学等课题的开展。同源建模Homology modeling是利用已知的蛋白质三级结构为参照，分析氨基酸序列相近的新蛋白的三级结构的技术。给定氨基酸序列，通过Modeller等建模软件获取蛋白质建模三维结构，并通过分子动力学分析获取初步的可靠蛋白结构。若同源相似性较低的蛋白，可以通过从头建模Rosetta软件进行预测蛋白三维结构。 蛋白，DNA及RNA三维结构的预测为临床医生，药物设计进行分子生物学的研究提供了前提，一方面从结构角度了解生物大分子结构性质，另一方面便于后续进行分子对接，分子动力学等研究开展，进而辅助实验的进行及文章的发表。

服务内容2：药物分子对接计算-药物与蛋白、DNA、RNA等结合
分子对接是依据配体与受体作用的“锁-钥原理”，计算模拟分子配体与受体生物大分子相互作用的方法。分子对接主要分为“蛋白质-小分子”、“DNA-小分子”、“RNA-小分子”对接。药物小分子可以通过Autodock，Vina等软件与以上生物大分子进行对接能量分析，评估不同小分子配体与靶点蛋白的结合能力，从计算机模拟角度进行构效关系分析，并预测结合位点，辅助设计蛋白结构突变及进行药物小分子结构改造。
服务内容3：大分子对接-蛋白-蛋白结合，蛋白-DNA及蛋白-RNA等结合预测
分别采用HEX，ZDOCK，Rosetta等软件进行蛋白-蛋白对接，蛋白-DNA等对接，验证免疫共沉淀，GST-pull down等实验结果，并合理推测结合位点，并考察蛋白之间结合稳定性及残基能量贡献，为实验后续结构突变改造提供指导，为文章的写作锦上添花。
服务内容4：分子动力学模拟-蛋白结构优化，结合自由能计算等
通过分子动力学等方法，模拟蛋白,DNA及RNA等分子在不同温度，PH值，电压等各种条件下结构变化，预测不同分子间结合自由能，分析药物结合大分子后对其二级结构的影响，从而多角度阐述生物结构变化所导致的变化状况，阐明人体生物致病等生物性状机理。
分子动力学可以预测药物对蛋白二级结构影响，不同突变体影响结构的稳定性，蛋白与蛋白结合自由能分析等，在临床、药学及分子生物学领域起到重要作用，辅助课题的研究开展。

服务内容5：计算机辅助药物筛选&药物设计
利用Vina模拟计算软件，结合ZINC等化合物数据库，通过大规模计算虚拟筛选，分析数据库中可能潜在的结合力较高的化合物，致力于提供出色的计算机辅助药物设计支持和服务，缩短新药研发时间，为各类药物靶标提供设计解决方案。
通过与蛋白质三维结构模拟计算结合预测，彻底分析蛋白结合口袋周围理化性质、小分子结合口袋周围亲疏水作用性质、氢键作用、静电作用、范德华力作用等相互作用模式。

服务内容6：网络药理学技术服务
  近年来，网络药理学成为研究中药学的重要技术手段，通过提取鉴定中药中的有效成分，通过反向找靶寻找活性成分的特定基因，通过PPI网络分析和GO富集（或者KEGG富集分析）寻找特定的信号通路，从而为抗肿瘤或者抗血压等疾病寻找理论依据，加之分子对接等模拟手段，可以让文章更为充实。
计算模拟内容：
1：蛋白，DNA,RNA三维结构预测
2：药物与蛋白，DNA,RNA等结合方式及结合位点预测
3：蛋白-蛋白，蛋白-DNA，蛋白-RNA等结合方式及结合位点预测
4：分子动力学分析药物蛋白结合，蛋白-蛋白等结合及结合自由能
5：反向或者虚拟筛选预测某些靶点蛋白的潜在药物分子结构
6：网络药理学技术分析
面向客户：
药物化学，药物研发，中药学，有机化学，临床医生，天然药化，生物化学，分子生物学，食品及环境科学等相关领域学术研究人员